企业注销申请被驳回的原因主要包括分公司或子公司尚未注销、提供的凭证、账簿和报告无效或不完整、非正常户未办理税务注销、存在经营异常、法律法规规定的其他情形等。分公司或子公司尚未注销：在企业注销过程中，如果存在分公司或子公司，必须先将这些分支机构注销，否则会影响整个企业的注销进程。提供的凭证、账簿和报告无效或不完整：企业在正常经营过程中需要保持良好的纳税、申报和分类账记录。如果提供的凭证、账簿和报告无效或不完整，将导致注销申请被拒绝。非正常户未办理税务注销：对于非正常户企业来说，在申请注销前需要先办理税务注销手续，否则注销申请将无法通过。存在经营异常：如果企业存在经营异常的情况，如未按照规定的期限公示年度报告等，需要先进行公示并解决异常状态，然后才能申请注销。法律法规规定的其他情形：根据《中华人民共和国公司法》等相关法律法规的规定，企业注销还需要满足其他条件，如完成清算程序、清偿债务等。如果企业未满足这些条件，注销申请也将无法通过。综上所述，企业在提交注销申请前需要仔细核对所需文件和条件是否齐全并符合要求，以避免因各种原因导致注销不通过的情况发生