开端：
1559年7月，畠山高政正式开始改革，畠山高政将除防备北畠家的南部部队和防备手取城的部队全都解散领士兵归田；同时派人联系葡萄牙商队，偷偷从葡萄牙商队手中买了臼炮，通过试验发现臼炮的威力比大筒强上几倍；又传令组建新式近战部队，派家臣到全国各地寻找剑技高超的人，组建了剑豪部队。在组建部队时，畠山高政又命令工匠营建收取城，并在南部的崛内新宫城修建弩箭塔工事以备北畠家的进攻。

1559年11月，畠山高政将臼炮部队和剑豪部队开拔至铃木家边境。铃木家只是杂贺城的小大名，但是他向畠山家的勒索却堪比三好家，畠山高政在前几次的勒索都满足了铃木家，这样却导致铃木家的变本加厉，畠山高政忍无可忍打算对铃木家发起突然进攻。夜里，在睡梦中的铃木佐大夫被轰隆声惊醒，这时家臣赶紧汇报说：“畠山高政率领部队进攻过来了，现在在外城区。”铃木佐大夫出内城一看，远处的大炮发出耀眼的火光有规律的轰击着城墙。铃木佐大夫吩咐好守城将领，自己则从小门出城找到火枪部队企图袭击畠山家的侧翼。但是杂祝城的陷落比他预想的快，当他率部到打城郊时畠山家的部队已经进城了，铃木佐大夫最后在打几周的游击后被捉住沦为了俘虏。在北线打得热火朝天时，南面的战斗也开始了。北畠家在同月发起了对崛内新宫城的进攻，驻守的游佐新信教带领部队展开了顽强的抵抗。

结束战斗打扫战场时，畠山高政发现了铃木家存放的短炮和马，于是又组成了铁炮骑兵部队。经过一段时间的修整后，畠山高政将铁炮骑兵、臼炮和一支近战部队化为北军由伊条政康指挥，进攻本州岛的三好家城市；而自己率领剑豪和大弓部队组成的西军进攻四国岛的三好家城市。

北军在进攻时，由于三好家又正在与筒井家战斗没有意料到畠山家的进攻，于是在毫无抵抗的战斗下北军成功拿下岸和田、堺、高屋三城。进攻四国的南线部队不同，他们成功登录后拿下了腾瑞城，之后三好家的部队赶来，西军与三好部队在城郊发生了大战。畠山家在这场战役中损失较大但是成功将大部分四国的三好部队消灭了，然后顺利拿下四国。此时的南边成功拿下曾恨城，北畠家又在与志摩水军作战，无心收复曾恨城。

北军方向，原本统一战线的筒井家却背叛了我们，转头进攻刚刚攻下高屋城。此时的北军装备了从葡萄牙商队买来的新式火枪，威力比铁炮骑兵高，但是移速没有铁炮骑兵快。伊条政康指挥打退了筒井家的一次进攻后，转头进攻了筒井城并夺取了筒井城。

此时周围的形势对河内畠山家不利，大名们看到了河内畠山家渐渐显露出的锋芒，而组成了反畠山崛起联盟。北军攻下筒井城后联合伊纪国新出发的部队合力拿下了筒井家。在四国方向，西军的进攻部队在平定四国三好家的残余势力后准备向三好最后的领国进发。南线的部队也准备向着一之濑城进攻。

伊条政康的北军继续进攻到达了石山御坊和饭盛城，并在此处休整部队，准备一举拿下二条御所。四国征讨三好家的部队已经征服了三好家，正在从花隈城登陆本州岛。在筒井城，畠山高政组建了由铃木重秀率领的东军，下辖两支火枪部队和剑豪部队，东军主要的进攻方向是东方向，先与南线的部队一起拿下北畠家，再整合南线的部队一起进攻尾张国和三河国。

在1562年的4月，北军在修整后发起了以控制足利幕府为目标的二条御所战役，北军势如破竹在高槻城防御本愿寺家的进攻，在槙岛城防御足利幕府和周边大名的进攻，在北军顽强的攻势下，成功拿下二条御所，足利义辉赶忙逃出二条御所。当二条御所陷落的消息传开时，其他大名的进攻变得激烈，北军开始了残酷的二条御所守城战。在东线趁着伊势国的空虚，铃木重秀率领东军一举发动消灭北畠家的战役，较轻松的夺取伊势国并派遣先头部队进攻三河国

最后，在北军战线，北军攻下了足利幕府最后的一座城市。足利义辉见其大势已去，向河内畠山家投降。虽然足利幕府投降了，但是进攻二条御所的大名部队仍没有停下进攻，保卫战仍在继续。东线的进攻比北先容易许多，先头部队已经进入尾张国和三河国。

终章：
随着二条御所保卫战的结束，北军由防御转入进攻。畠山高政对于愿意臣服的大名宽恕，而不愿意臣服大名畠山高政都将其征服。最后，随着与长尾家的议合，原本只是一个小大名的河内畠山家摇身一变成为天下霸主——征挑胜利。

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