手术室净化效果的好坏关系到手术操作成败和医疗工作质量，而合理的布局是保证净化效果的关键。一般来说，手术室净化的布局方式主要有以下五种：
1.单走廊型，普通手术室多采用单廊型布局，消毒品、污物、医护、患者共用一条通道，手术间布置在一侧，其他辅助用房布置在另一侧。术后废弃物须就地取材包装，加工后方可运出术间，使污物不致传播，否则难以避免交叉感染。这种形式手术室以设置前室为好，但有其面积要求。
2.双走廊型（污物廊），双走廊型手术室是常用的布局形式；内走廊为医护、患者和消毒品通道，外走廊为污物通道。

3.双走廊型（清洁廊），该形式的手术室净化平面布置大致和双走廊式（污物廊）相似，清洁廊为外走廊，为消毒品和医护通道。内走廊为患者、污物通道，此形式更有利于对消毒物品的管理。
4.中央岛型，手术室设置无菌物品专用通道，由专门的护士对无菌物品进行存放和分发。无菌品的储存一侧通手术间，另一侧通供应区。供应区由专用洁净电梯通往消毒供应中心。这样，无菌物品成为了最洁净的“中心岛”，被所有洁净手术室所包围。手术室外廊为污廊，手术患者和术后的医护人员及污物动线置于外廊。此类型手术室物流清晰，有利于对无菌品的管理，但对面积和人力成本要求较高。
5.单流向型，手术室净化严格遵守洁、污分流原则，病人、医生、无菌物品，都是单向流，不允许逆向流。两者之间互相彻底不交叉，是解决洁、污分流的最彻底的布局方案。但这一类的手术室净化，随着手术室数量增多，平面流向和设计将变的相当复杂。以上五种布局类型各有利弊，在实际建设使用中，应综合考虑洁净度要求、建筑条件、消毒品管理、手术周转效率、管理成本等因素。