开启机巢秘境可以通过多种方法来实现。首先，玩家可以在游戏中购买“机巢之门”，使用该物品可以打开机巢秘境的入口。其次，玩家也可以直接到达机巢的起始位置，然后使用“念力之门”进行打开。此外，一些游戏内的NPC也会提供帮助，将传送门带到机巢里去。在一些特殊情况下，如遭遇大量怪物时，也可以使用神器来打开机巢之门。此外，还有一些特殊的情况下会出现隐藏的关卡入口条目（如神庙、金字塔、神龙宫、雪原、海底密室、海底水下密室、魔法竞技场和无尽幻想园等地方都会出现隐藏的关卡入口条目) ，通过这些隐藏的关卡入口条目就能够进行机巢副本的开启了。