凯门鳄在不同时期有不同敌害。卵期：黑点双领蜥、发冠长脚鹰、食蟹狐、浣熊、长鼻浣熊和戴帽猴等。幼鳄：鲶鱼等食肉性鱼类、靛青蛇、毛缘髭龟、蟾龟、虎鹭、白领鹭、夜鹭、美洲林鹳、南美杂色鹳、杰伯鲁鹳、大黑鹰、食蟹狐、虎猫等。成年：黑鳄、美洲鳄、奥里诺科鳄、美洲豹和绿森蚺。