藻蓝蛋白是自然界中少见的色素蛋白之一，不仅颜色鲜艳，而且本身是一种营养丰富的蛋白质，其氨基酸组成齐全，必需氨基酸含量高。
藻蓝蛋白具有抗癌、促进血细胞再生、养护卵巢、促使人体内合成弹力蛋白等功效。21世纪初，在欧美、日本等国，藻蓝蛋白广泛用作食品和化妆品的高级天然色素，并被制成生化药品。1986年，由日本康派艾滋病研究所研制、CONFIDENCE藻类营养食品公司生产的康派奇（confident）藻蓝蛋白素作为癌症患者、白血病患者等的康复药品和营养食品，取得突出的配合疗效。
1、调理更年期综合征
藻蓝蛋白所富含高活性的藻蓝蛋白素能有效调节内分泌，对更年期综合征的失眠、多梦、头晕、目眩、烦躁、不安、猜疑、忧郁等症状表现有很好的调理作用。
2、美容养颜
藻蓝蛋白含有大量的藻蓝蛋白素，可以改善毛孔粗大现象，祛除黄褐斑，消退青春痘，让皮肤充满弹性，细腻、滋润，有光泽。
3、平稳血糖血脂
藻蓝蛋白所含的藻蓝蛋白素有明显的平稳血糖的作用，而藻蓝蛋白所含的黄酮类化合物有平稳血脂作用，故藻蓝蛋白常被用于防治“三高”病症。
4、防癌抑癌
藻蓝蛋白已被证明能抑制癌症细胞扩展。科学家研究发现，藻蓝蛋白有明显抑制癌细胞的功能。可以制成抗肿瘤的辅助治疗药物，用以化疗的辅助治疗可增强机体的免疫力。
5、保护心脏
藻蓝蛋白所含的藻蓝蛋白总黄酮和藻蓝蛋白素能改善心肌的氧代谢，还能扩张血管，改善微循环，从而可以防治心肌梗死、心肌缺血、心律失常、高血压和动脉硬化等疾病。
6、预防骨质疏松
藻蓝蛋白可以减缓骨骼组织细胞的老化,有助于人体对钙质的吸收，防止体内钙质流失的作用，帮助预防骨质疏松。
7、解酒护肝
藻蓝蛋白富含卟啉类色素蛋白，能有效分解酒精，减少其对大脑和肠胃的刺激，促进新陈代谢，加速排解掉酒精以及残留在肝脏当中的毒素，从而起到保护肝脏的作用。
8、抗氧化，清除自由基
藻蓝蛋白能够促进细胞活性，清除体内自由基、改善卵巢功能、促进人体快速合成弹力蛋白。据科学研究表明，藻蓝蛋白具有刺激红细胞集落生成，类似红细胞生成素(epo)的作用；能够调整白血球和提高淋巴细胞活性的作用；增加体能、促进红血球增长，能增进机体免疫功能，促进生长发育。
9、益智健脑
研究表明，藻蓝蛋白所含的藻蓝蛋白提取物对学习记忆障碍有明显的治疗作用，还可用于防治老年性痴呆、智力障碍、记忆力减退等病症。
10、解表发热
藻蓝蛋白的藻蓝蛋白丙酮提取物可起到使体温恢复正常的作用，对多种发热有效，常用于发热口渴、心烦不安等病症。