庵野：佐菲操纵杰顿的设定，是根据当时初代TV放送时的杂志记述而来的。从宇宙人佐菲的介绍来看，杂志和TV本篇的内容是相悖的，但因为学习不足一直不知道（这个古早的杂志描述），这还是十几年前从大月先生（前圆谷董事）那里第一次听来了解到的。那个时候，我觉得最后的敌人是奥特曼的同族人真是太好了。所以在本作中，基于佐菲操纵杰顿这点展开了最后一幕的内容。

设定集：
存在银河联邦。也存在星间条约，条约内容=对于其他天体的武力镇压只能靠生物兵器。
为什么会有这样的条约，是因为太古时代因星间侵略战争让诸多智慧生命体蒙受灭顶之灾。基于反省，所以签了只能用生物兵器来打仗的条约。正因这个条约，许许多多外星人才没有灭亡。
因为生物兵器是最难进化与运用的。这一条约也适用于没有得到开发或者没有缔结此条约的星球。
人类也是发展中的不成熟的生物兵器。是外星人（这里的外星人=奥特曼母星=光之星）埋下的生命之种。
贝塔胶囊=贝塔系统发动用点火器。
贝塔系统，即将光能源凝缩固定变成物质的一个系统。在地球上太阳是主要供给能源。
主人公和奥特曼的身体情报都保存在里面，变回去必须要有贝塔胶囊。
但也构想过贝塔胶囊=将保管在其他相位空间内的身体转移到这个次元的器具。
一旦点火，地面上便会出现巨大的透明手握住主人公。然后变成银色慢慢巨大化。
继而头部左臂胸部相继出现，红色的线条也在身上明晰可见。
不会有彩色计时器，但花纹颜色会随着时间经过而变化。
人类能和奥特曼融合是因为两者是同种。奥特曼是进化直至究极的人类型。
奥特曼对于人类抱有好感，是人类的保护神也是监视者。
人类以群而生，但奥特曼却是以单个个体而生。
地球重力下，奥特曼身高60米，体重900吨。

美菲拉斯初企阶段相关情节：
1、飞来的美菲拉斯。知性的美菲拉斯不会巨大化。
2、美菲拉斯和主人公的对话——
『战争也是外交的手段之一，但我讨厌暴力。我想在取得正当程序之后，正式管理这颗星球。』
『我已经向银河连邦提交了申请，这是按照《星间条约》进行的。虽然还不成熟，但这是具有认知能力的生命体。我尊重群体，但也有自己的想法。』
『我想保护这个美丽星球上的生命体，为此我必须管理人类这个物种。』
3、让女队员巨大化的美菲拉斯——
“这项技术并非奥特曼独有。”
美菲拉斯意在提供使人类生物武器化的技术。日美政府打算将贝塔系统用于军事。
4、美菲拉斯试图通过国民投票来控制人类——
『让我来管理人类吧。』
美菲拉斯聚集支持者，推进ZZ工作和经济统治。
各国领导人不接受美菲拉斯，并将其从人类的支持者中排除。美菲拉斯被逼到绝境。
5、为了说服美菲拉斯，主人公留在了预定轰炸的地点——
『你的提案被驳回了。我希望你认输，离开这个星球。』
『这个星球上的人类不允许有进一步进化的存在。你我迟早都会被强制排除。在此之前看清这个星球是我的使命。为了了解人类的本质，我会留在这个星球上。』
6、人类把不愿离开的主人公与美菲拉斯一起减却（轰炸）。 最后，奥特曼一人独自伫立在燃尽的原野上。