您提到在使用MediaCoder进行视频转码时，发现将H264 6000码率的视频转码为H264 3000码率和H265 3000码率的视频后，得到的文件大小分别为1006M和998M，这与您预期的“同质量更小”不符。这里有几个可能的原因：
1. **视频质量保持**：转码时，如果选择了保持视频质量不变，那么转码后的视频大小可能会因为源视频的复杂度而有所不同。即使码率降低，如果视频源本身就包含大量的细节和动作，那么在低码率下要保持相同的质量，文件大小可能不会有太大的减少。
2. **码率和分辨率**：确保转码后的分辨率与源视频相同。如果分辨率降低，那么文件大小会相应减小。但如果分辨率保持不变，文件大小不会有太大的变化。
3. **编码效率**：H265（HEVC）编码比H264（AVC）更高效，理论上在相同码率下，H265编码的视频文件应该更小。但是，如果源视频已经非常优化，或者压缩效率已经接近极限，那么转码后的文件大小差异可能不会很明显。
4. **其他因素**：转码过程中可能存在其他因素，如音频轨道的编码、元数据信息等，这些都会影响最终的文件大小。
以下是一些建议来优化您的转码过程：
- **检查分辨率**：确认转码后视频的分辨率是否与源视频。
- **调整编码设置**：尝试调整H265编码的设置，例如使用更高的压缩率或调整编码预设，以便在低码率下获得更好的压缩效果。
- **考虑视频内容**：如果视频内容本身很容易压缩（例如静态画面），那么转码后的大小会相对较小。反之，如果视频内容复杂，即使码率降低，文件大小显著减小。
最后，确保您在MediaCoder中选择了正确的转码设置，并且没有其他的选项影响到转码结果。