尽管安全套为人类健康做出了很大的贡献,但总还是有一些科研人员和性专家对安全套持否定的态度。
罗马天主教会反对任何婚姻外的性行为,以及任何人为的避孕措施,比如结扎和安全套。安全套作为降低性传播疾病的优点并不被罗马天主教会所关注,他们关心的是安全套对于神学家和高级天主教当局所造成的影响。

2009年,教皇保罗十六世认为使用安全套会鼓励人们滥交,从而实际上增加了疾病的传播。作为世界上最大的宗教组织,他们向非洲派出了数百名防艾工作人员,但却反对使用安全套的方案饱受争议。

2011年11月对保罗十六世的采访中,教皇首次讨论了关于安全套预防性疾病传播的话题,他说“如果安全套用于预防HIV病毒传染目的而言,对于某些人是可以接受的”。关于所指的某些人他举了一个男妓的例子,但保罗并没有把“某些”解释清楚,不知道他是否专指同性卖淫还是包括所有的性行为。然后,梵蒂冈发言人Federico Lombardi指出:教皇所阐述的对象包括异性恋和变性人,不管男性还是女性。同时他也强调了教会对性行为和避孕的立场从未改变。